哈佛医学院招收计算生物学博士后
哈佛医学院贝斯以色列女执事中心的Fujisaki博士和Vlachos博士的实验室提供联合博士后职位。通过整合单细胞测序数据、前沿的空间转录组学和应用于人类样本和转基因小鼠模型的双光子显微镜，成功的候选人有望提出“干细胞免疫学”这一新领域的新问题。
计算生物学博士后将成为由干细胞免疫实验室(Fujisaki)和计算生物学实验室(Vlachos)组成的合作团队的一员。他们将有机会领导具有高影响力的项目，并接受单细胞和空间数据分析前沿技术的培训。博士后将隶属于哈佛医学院的空间技术部门(www.spatialtechnology.org)和布罗德学院麻省理工学院和哈佛大学。
尽管肿瘤免疫治疗和干细胞移植的应用越来越多，但对正常或恶性干细胞的免疫反应的基本调节机制仍未得到很大程度的探索。藤崎博士的实验室专注于干细胞免疫学这一新领域的这些问题。藤崎博士的团队专门测试了这个小生境是否可以作为干细胞的免疫避难所。理论上，这将保护正常/恶性/移植干细胞免受免疫攻击，以及细胞应激反应。20世纪50年代的研究表明，睾丸和胎盘是免疫特权位点，即使在没有免疫抑制的情况下，移植的异体或异体移植物也可能长期存在。虽然最近在各种组织中发现了组织承诺的干细胞生态位，但生态位本身还没有在免疫学背景下进行评估。事实上，尚不清楚体细胞干细胞龛是否具有广泛的免疫特权。我们最近证实，造血干细胞(HSC)在骨髓内的生态位容纳一种独特的调节性T细胞群，使该生态位具有免疫特权(细胞干细胞22, 445-453, 2018;自然474(7350)， 216-9, 2011)。
为了进一步深入了解免疫特权，并促进将其转化到临床环境，Vlachos博士的实验室组成了合作团队，应用单细胞数据分析，细胞受体剖析，空间转录组学，高通量免疫肽分析，和生物信息学/系统生物学的方法，了解肿瘤微环境和免疫治疗的反应(免疫检查点抑制剂也是车-T细胞和树突状细胞/肿瘤细胞融合疫苗)，以及炎症和组织损伤中的细胞串扰(自然595, 107-113, 2021)。Vlachos博士目前是生物信息学、空间转录组学的大规模计划和核心的领导、共同领导或贡献BIDMC和哈佛大学。
成功的申请人将获得具有竞争力的薪酬和福利待遇。
该职位的目标是具备强大的定量和计算的背景知识在基因组学/转录组学方面有丰富的经验(分析不同的批量/单细胞/空间下一代测序技术以及新方法的开发）.
必要的技能
- 有丰富的处理和分析下一代测序数据的经验
相关领域的博士学位(计算生物学，人口遗传学/基因组学，生物信息学，生物统计学)
- 强大的定量背景(如计算机科学、应用数学、工程、生物统计学理学士)
- 具有使用R/Bioconductor进行生物信息学/数据分析的经验
- 具有基于linux的环境和高性能计算的经验
- 优秀的编程技能
- 有效的科学传播
理想的技能
- 单细胞和/或空间组学数据分析经验
- 强大的出版记录
- 领导和协调广泛的项目
对于方法构建者，我们也欢迎链接到github/bitbucket页面，以及相关的生物信息学/计算生物学/机器学习社区贡献。
我们是一个机会平等的雇主，我们欢迎来自妇女，残疾人，受保护的退伍军人和少数群体成员的申请。
鼓励本地及国际申请人申请
有意者请将简历发送至藤崎丈二博士(jfujisak@bidmc.harvard.edu)及瓦拉科斯博士(ivlachos@bidmc.harvard.edu）.
Fujisaki博士是纽约哥伦比亚大学的前副教授。Fujisaki博士最近被聘为哈佛医学院贝斯以色列女执事医学中心新建立的炎症研究中心的副主任。Fujisaki博士的实验室位于Longwood医疗区的生命科学中心大楼内。
Vlachos博士是哈佛医学院的助理教授，也是Broad Institute of the Harvard Medical School的副成员麻省理工学院和哈佛大学。Vlachos博士是癌症研究所生物信息学项目的联合主任和生物信息学主任(https://noncodingrna.org/bioinformatics-unit/)及空间科技组(www.spatialtechnology.org)，哈佛医学院的倡议核糖核酸贝斯以色列女执事医疗中心Vlachos博士的实验室位于Longwood医疗区的Dana大楼。
Joji Fujisaki，医学博士
副主任
炎症研究中心
麻醉与医学部
临床免疫学研究室“，
贝斯以色列女执事医疗中心
哈佛医学院
Ioannis Vlachos博士
哈佛医学院助理教授
布罗德研究所准会员麻省理工学院和哈佛大学
癌症研究所生物信息学项目联合主任
哈佛医学院空间技术中心主任核糖核酸医学
哈佛医学院生物信息学主任核糖核酸医学
贝斯以色列女执事医疗中心病理科