弗朗西斯克里克研究所

博士后培养人员x2:免疫学与计算生物学

弗朗西斯克里克研究所

英国伦敦

职位薪酬:

38,300英镑起,视技能和经验而定

报告:

莫里茨Treeck

职位描述:

合同

4年,有可能延长到5年。

总结

2个维康信托基金资助的Moritz Treeck实验室博士后研究职位(免疫学和计算生物学)www.treecklab.org)。我们正在寻找好奇的研究人员来研究效应蛋白的复杂相互作用,最成功的寄生虫之一,刚地弓形虫,注入宿主细胞。新型单细胞测序方法结合CRISPR寄生虫中的筛选和宿主细胞中的转录反应分析将被用来绘制所有的地图弓形虫在不同宿主和细胞类型中改变宿主细胞行为的效应蛋白。效应蛋白的功能将在细胞培养和研究在活的有机体内研究注入宿主细胞的效应蛋白如何导致免疫反应的系统性变化。该项目将吸引那些对细胞生物学和宿主-病原体相互作用的先天免疫学以及单细胞测序数据集的复杂分析感兴趣的人。与弗朗西斯克里克研究所的免疫学和细胞生物学小组的广泛合作,以及Manfred Claassen教授使用机器学习方法共同监督计算工作,提供了一个令人兴奋和多样化的框架。

弓形虫作为一种病原体,它是一种真正的多面手,可以感染任何温血动物的任何有核细胞,包括约30%的人类。为此,寄生虫将效应蛋白分泌到宿主细胞中,使宿主细胞的正常行为恢复到对寄生虫有利的状态,从受感染细胞内的细胞自主免疫反应到改变细胞因子分泌,从而创造一个有利的感染环境。它是如何跨越物种和细胞类型实现这一目标的尚不清楚。

在约220种预测效应蛋白及其对宿主的影响中,只有少数已被表征,这往往导致对宿主-病原体相互作用的重要和新颖的见解。然而,大多数效应子的功能未知,并有很大的希望揭示寄生虫如何破坏宿主免疫反应的新机制。为了解决这个问题,实验室已经开发了新的方法,例如结合寄生虫的微扰q技术CRISPR(Young J, et al., 2019,PMID: 31481656)和感染宿主细胞的单细胞RNAseq实验。

为了完成这项工作,我们正在寻找2名对感染生物学和宿主-病原体相互作用有强烈兴趣的博士后。我们特别希望求职者具备以下任何一种背景:

  • 先天免疫系统的细胞免疫学。很好地了解先天免疫系统及其组成部分如何共同发挥作用是可取的。必须有与老鼠打交道的经验。

  • 计算生物学。扎实的生物信息学/统计学背景和解决高度复杂的生物问题的热情是必不可少的。有单细胞测序数据分析经验者优先。其主要作用将是在新的宿主-病原体相互作用背景下开发多模型单细胞测序的分析方法,但也可能有机会参与湿实验室数据生成。该职位将由高级单细胞分析方法专家Manfred Claassen教授(https://www.medizin.uni-tuebingen.de/de/das-klinikum/mitarbeiter/profil/2147).

博士后培训研究员将领导自己的项目,在合作的基础上为其他项目做出贡献(无论是在实验室还是与外部合作者),并指导博士生进行研究。

关于我们

该项目补充了实验室正在进行的研究,以确定寄生虫的效应蛋白,这些效应蛋白对受感染细胞内的生存至关重要。在实验室里,我们培养了一群来自不同科学背景的科学家,并使用一系列技术来回答我们的问题,包括定量蛋白质组学,CRISPR屏幕,单细胞核糖核酸Seq,免疫学,细胞生物学和生化方法。看到www.treecklab.org对于实验室和项目的概述。对于这项工作的计算部分,我们与图宾根大学Manfred Claassen教授的实验室密切合作,他将机器学习方法应用于复杂的单细胞分析。因此,我们有一个由志同道合的科学家组成的多元化团队,他们可以相互学习,以协作和有趣的方式解决问题,同时为团队内部建立独立的利基提供了巨大的空间。

的克里克拥有广泛的研究资料。由于没有部门,我们的研究小组可以自由地在广泛的领域内制定研究计划。我们是合作和外向的,反映了我们作为六个组织的伙伴关系,旨在汇集知识、想法和资源。

我们在生物医学研究的最前沿进行着最高质量的研究。我们将这种严谨与开放互动的文化相结合,将具有不同研究兴趣和专业知识的人员聚集在一起,包括来自制药合作伙伴的临床医生、物理科学家和应用科学家。

我们的目标是吸引最有才华的研究人员,并支持他们解决创新的研究问题,在实验室之间共享资源。我们的科学技术平台为我们的研究人员提供了最先进的技术和专业知识。我们提供良好的学习环境,在科学推广、教育和个人发展方面提供专门的教育计划,以及博士后培训计划,为科学家在学术界和工业界担任领导角色做好准备。

  • 如果你有兴趣申请这个职位,请通过我们的网站
  • 一份详细说明你申请的两个职位,以及你的研究技能和兴趣如何与这个项目的目标相一致的求职信是绝对必要的。
  • 没有截止日期:职位将在确定合适的候选人后填补。预计从2022年2月开始,直到所有职位都被填补。

我们鼓励有兴趣的候选人询问该职位是否仍然空缺。

  • 所有的就业机会都必须通过安全审查,并持续获得在英国工作的资格。
  • 非正式的要求可以向moritz.treeck@crick.ac.uk

基本资格、经验和能力

  • 与上述领域相关的博士学位,或博士论文提交的最后阶段
  • 在上述领域有丰富的知识和经验
  • 在上述领域的技术专长
  • 有发表论文或在相关期刊上投稿的记录。据了解,COVID导致稿件提交中断。
  • 在科学会议上展示数据的证据
  • 实验设计经验
  • 能够独立工作,并能在团队中进行互动

请通过招聘网站申请。