威康桑格研究所

首席数据科学家

威康桑格研究所

英国剑桥

你想帮助我们改善人类健康,了解地球上的生命吗?通过塑造未来来实现或提供改变生活的科学来解决人类面临的一些最大挑战,从而留下你的印记。

职位简介:

我们正在寻找一名机器学习科学家加入细胞遗传学项目,担任首席数据科学家。

你将负责:

你将参与并领导单细胞生物学和机器学习交叉领域的特定数据科学项目。您将使用开源软件,提出、开发和维护新的解决方案,以分析和解释大规模单细胞数据集。

你将加入一个由生命科学家、计算机科学家和数学家组成的跨学科团队。我们都相互学习,共同努力,在细胞遗传学计划内实现雄心勃勃的研究目标,并支持桑格研究所的使命,即“利用基因组序列的信息促进对生物学的理解和改善健康”。

在这个角色中,你将:

提出、开发和评估新的机器学习模型,以理解单细胞数据及其在药物发现中的应用。

带头与博士生和博士后合作,为生物学领域的跨学科科学问题开发解决方案。

带头和合作撰写针对生物技术和生物学的科学论文。

将您开发的解决方案提炼成开源和易于安装的包,并带有文档,有助于下游用户(包括生物学家和生物信息学家)使用您的解决方案。

关于我们:

小组的相关出版物:

Lotfollahi, M., Naghipourfar, M., Luecken, M., Khajavi, M., Büttner, M., Wagenstetter, M., Avsec, Ž。, Gayoso, A., Yosef, N., Interlandi, M.等。通过迁移学习将单细胞数据映射到参考地图集。自然生物技术1-10(2021)。

Lotfollahi, M., Wolf, F. A. & Theis, F. J. scGen预测单细胞扰动响应。自然科学进展16(2019)。

Lotfollahi, M., Klimovskaia, A., De Donno, C., Ji, Y., Ibarra, I. L., Wolf, F. A., Yakubova, N., Theis, F. J. & Lopez-Paz, D.在高通量屏幕中学习对复杂扰动的可解释细胞反应。bioRxiv (2021), Nature Biotechnology正在修订中

罗福拉希,M. Naghipourfar, M. Theis, F. J. & Wolf, F. A.条件分布外生成的未配对数据使用传输VAE.生物信息学36,i610-i617(2020)。

Lotfollahi, M., Rybakov, S., Hrovatin, K., Hediyeh-zadeh, S., Talavera-López, C., Misharin, A. V. & Theis, F. J.生物信息深度学习推断单细胞中的基因程序活动。bioRxiv 2022.02.05.479217, doi:10.1101/2022.02.05.479217(2022),在自然细胞生物学修订版

关于你:

你将有计算生物学/生物信息学的背景,并寻找机会将你的知识应用于单细胞数据和药物发现中的应用。有使用云环境和工具(如Amazon)的经验AWSS3、EC2等是额外的。


基本技能:

相关定量学科(如计算机科学、计算生物学、遗传学、生物信息学、物理学、工程学或应用统计学/数学)硕士(或同等学历)或博士(

使用先进的统计技术、机器学习和现代深度学习技术的经验。

熟悉Python,包括核心数据科学库,如Scikit-Learn, SciPy, TensorFlow和PyTorch。

了解软件开发的良好实践和协作工具,包括基于git的版本控制、python包管理和代码。

能力和行为:

优秀的沟通技巧,能够与团队成员和合作者进行有效的互动

能够与内部和外部各级利益相关者建立协作工作关系

有撰写出版稿件的经验

高度发展的解决问题的能力

有督导经验(博士生和博士后)

良好的时间管理和项目管理能力

对问题具有批判性和分析性思维

研究刊物记录

年薪:50388 - 59862英镑

申请过程:

请附上你的简历和求职信,概述你如何满足上述标准和职位描述。

在威康桑格工作

我们灵活的混合工作环境意味着您可以专注于生产力和团队的一部分,同时享受远程工作的好处,从基因组校园当你在办公室。

我们的目标是从尽可能广泛的人才库中吸引、招聘、留住和培养人才,从而获得洞察力和进入不同市场的机会,从而对世界产生更大的影响。我们拥有以下员工网络的支持性文化,LGBTQ+,父母和护理人员以及种族平等,将人们聚集在一起分享经验,提供具体的支持和发展机会,并提高意识。该网络也是盟友向其他国家提供支持的地方。

我们希望我们的员工成为他们想成为的人,因为我们相信,带着最好的自己去工作的人,会把工作做得最好。这就是为什么我们致力于在桑格研究所创造一个真正包容的文化。我们将不歧视地考虑所有个人,并致力于为所有员工创造一个包容的环境,让每个人都能茁壮成长。

请通过招聘网站申请。