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培养和非培养原核生物命名的统一系统

大多数原核生物不容易在实验室中培养和作为纯培养物分布。因此,这些生物体无法被正式命名。一个命名代码——SeqCode——提供了在基因组数据的基础上命名这类生物体的途径,旨在统一微生物学的现场和实验室研究。

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图1:如何用SeqCode注册原核生物名称。

参考文献

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    文章中科院谷歌学者

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    文章谷歌学者

  3. 未培养的古生菌和细菌命名路线图。Microbiol Nat。5, 987-994(2020)。来自22个国家的121位作者发表了一份共识声明,建议修订ICNP或开发一种新的代码,使DNA序列数据能够作为命名类型。

    文章中科院谷歌学者

  4. Chaumeil,中国。et al。GTDB-Tk:一个使用基因组分类数据库对基因组进行分类的工具包。生物信息学36, 1925-1927(2019)。这篇手稿讨论了基因组分类数据库工具包(GTDB-Tk),一个现代系统的例子,分类原核生物的基础上的基因组数据。

    公共医学中心谷歌学者

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    文章中科院谷歌学者

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这是一个总结:Hedlund, b.p.等人。SeqCode:由序列数据描述的原核生物的命名代码。Nat。Microbiolhttps://doi.org/10.1038/s41564-022-01214-9(2022)。

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引用本文

培养和非培养原核生物命名的统一系统。Nat Microbiol7, 1514-1515(2022)。https://doi.org/10.1038/s41564-022-01220-x

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