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分析癌症中的致癌染色体外DNA

癌细胞经常在染色体外的DNA分子上扩增致癌基因——染色体外DNA。一种用于分离染色体外DNA的技术,称为CRISPR-CATCH,可以分析其遗传和表观遗传组成,从而深入了解其起源、结构多样性和癌症中致癌基因激活的机制。

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图1:通过CRISPR-CATCH分析癌细胞中的ecDNA。

参考文献

  1. 特纳,K. M.等。染色体外癌基因扩增驱动肿瘤进化和遗传异质性。自然543, 122-125(2017)。本文系统地分析了人类癌症模型,以确定ecdna及其对癌基因表达的影响。

    文章PubMed公共医学中心中科院谷歌学者

  2. Hung, K. L.等人,ecDNA中心驱动协同分子间癌基因表达。自然600, 731-736(2021)。本文描述了ecDNA枢纽的形成作为一种机制驱动高水平的癌基因表达。

    文章PubMed公共医学中心中科院谷歌学者

  3. Kim, H.等人。染色体外DNA与多种癌症的癌基因扩增和不良预后相关。Nat,麝猫。52, 891-897(2020)。本文分析了来自癌症患者的肿瘤测序数据,并提出了ecDNA与患者生存率下降之间的联系。

    文章PubMed公共医学中心中科院谷歌学者

  4. van der Bliek, a.m., Lincke, C. R. & Borst, P. 3T6R50双分钟染色体的环状DNA。核酸测定。16, 4841-4851(1988)。本文证明了大的DNA环在PFGE中不会迁移,但可以在诱导DNA断裂后被动员起来。

    文章PubMed公共医学中心谷歌学者

  5. 蒋,W.等。cas9辅助的染色体片段靶向CATCH使大基因簇的一步靶向克隆。Commun Nat。6, 8101(2015)。本文介绍了CRISPR-CATCH的工作流程,使用两切策略分离细菌染色体片段进行克隆。

    文章PubMed谷歌学者

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这是一个总结:张,h.y.等。利用CRISPR-CATCH对人类染色体外DNA进行定向分析。Nat麝猫。https://doi.org/10.1038/s41588-022-01190-0(2022)。

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分析癌症中的致癌染色体外DNA。Nat麝猫(2022)。https://doi.org/10.1038/s41588-022-01193-x

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