克隆造血的多组学分析

克隆造血的多组学分析

单细胞多组学技术定义了体细胞如何DNMT3A突变改变人克隆造血的细胞表型。

公告

自然遗传学是一个变革的杂志;作者可以使用传统的出版途径或通过即时黄金开放获取进行出版。

我们的开放获取选项符合资金和机构要求

广告

  • 高通量实验平台已经彻底改变了生物序列(如DNA、RNA和蛋白质)的生化和功能特性。通过整理几种数据模式和使用直观可视化呈现的可定制轨迹,基因组浏览器可以对不同类型的基因组分析实验和衍生注释进行交互式和可解释的探索。然而,现有的基因组浏览器轨迹并不适合于高分辨率DNA序列特征的直观可视化,如转录因子基序。通常,调控DNA序列中的基序实例被可视化为基于bed的注释轨迹,它突出了基序实例的基因组坐标,但不暴露其特定序列。相反,基因组序列轨道需要与BED轨道交叉参考,以确定基序命中的序列。即便如此,关于基序实例的定量信息,如亲和力或保守性,以及与共识基序的基本分辨率差异,并不是立即明显的。这使得口译变得缓慢而富有挑战性。当同时分析几种细胞状态和/或分子读出(如ATAC-seq和ChIP-seq)时,这个问题变得更加复杂,因为富集区域(峰)的坐标和活性转录因子基序的集合在细胞状态中变化。

    • Surag Nair
    • Arjun巴雷特
    • Anshul Kundaje
    评论
  • 许多大型研究项目已经累计招募了数千名患者,他们患有一系列复杂的医学问题,但没有明确的遗传病因。然而,尚不清楚研究人员、机构和资助者应如何管理这些数据,以及在研究结束时与那些未确诊的参与者之间的关系。在这篇评论中,我们概述了目前与临床基因组学研究中研究后义务相关的文献,并讨论了当前指南在未确诊参与者研究中的应用。

    • 梅根·c·哈雷
    • 尤安·a·阿什利
    • 霍莉·k·塔博尔
    评论

自然的职业

事件

工作

广告