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孟德尔随机化分析支持脑成像衍生表型和精神障碍风险之间的因果关系

摘要

观察性研究报道了脑成像衍生表型(IDPs)与精神疾病之间的相关性;然而,这些关系是否有因果关系还不确定。我们进行了双向双样本孟德尔随机化(MR)分析,以探索587名可靠的IDPs (N= 33,224人)和10种精神疾病(N= 9,725 - 161,405)。我们确定了9个有证据表明对精神分裂症、神经性厌食症和双相情感障碍风险有因果影响的IDPs。例如,1 s.d。大钳方向分散指数的增加与精神分裂症风险降低32%相关。反向MR显示,只有基因预测精神分裂症与两个idp、皮质表面积和右侧眶部体积呈正相关。我们建立了BrainMR数据库(http://www.bigc.online/BrainMR/)分享我们的研究成果。我们的发现为在脑成像水平上预测和干预精神障碍风险提供了潜在的策略。

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图1:国内流离失所者和精神障碍之间因果推论的工作流程。
图2:正向磁流变中的因果关系。
图3:逆向MR的因果关系。

数据可用性

除了Gelernter等人的创伤后应激障碍数据外,所有GWAS数据都是公开的。67.这些数据可通过dbGaP登录号获取phs001672.v1.p1.没有英国生物银行数据的重度抑郁症GWAS数据是通过联系精神病学基因组联盟工作组数据访问委员会代表(https://www.med.unc.edu/pgc/pgc-workgroups/major-depressive-disorder/).其他精神疾病的GWASs由精神病学基因组学联盟(https://www.med.unc.edu/pgc).所有公共数据集的下载链接可在补充表中找到2.脑内流离者的GWASs可于BIG40网页浏览器(https://open.win.ox.ac.uk/ukbiobank/big40/).NHGRI-EBI GWAS目录(v1.0.2-associtions_e104, 2021年10月22日发布)中的数据可从https://www.ebi.ac.uk/gwas/docs/file-downloads/.我们的研究结果发表在我们的在线平台上http://www.bigc.online/BrainMR/

代码的可用性

用于运行本研究中描述的分析的实际代码可在我们的在线平台(http://www.bigc.online/BrainMR/Browse/1.2-Code.html).我们在研究中使用的所有软件包都是公开的,下载链接包含在方法

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国家自然科学基金项目(资助号:32170616 (t - l.y .)、82170896 (Y.G.)、31970569 (Y.G.)、82101601 (S.Y.);陕西省杰出青年科学基金项目(资助号:2021JC-02 (t - l.y .));陕西省创新能力支撑计划项目(资助号:2022TD-44 (t - l.y .));中央高校基本科研业务费专项资金(t - l.y .)资助。该工作也得到了西安交通大学高性能计算平台与仪器分析中心的支持。我们要感谢英国生物银行和精神病学基因组学联盟的跨障碍小组提供的国内流离失所者和精神障碍的GWAS汇总数据。我们也感谢美国百万老兵计划和dbGaP。我们使用的创伤后应激障碍的GWAS汇总数据可从dbGaP数据库中获得,登录号为phs001672.v1.p1。我们感谢申请号为46387的英国生物银行资源。

作者信息

作者和隶属关系

作者

贡献

J.G.主持了这个项目并撰写了手稿。K.Y.建立了数据库网站并绘制了数据。s.s.d.和Y.G.修改了手稿。S.Y.申请了英国生物银行的数据,并提供了一些建议。Y.R.和H.W.为网上数据库画了图,收集了资料。k.z和f.j总结了英国生物银行的数据。y - x.c申请了dbGaP数据。t.l.y.和Y.G.构思并监督了这个项目。

相应的作者

对应到郭岩Tie-Lin杨

道德声明

相互竞争的利益

作者声明没有竞争利益。

同行评审

同行评审信息

自然神经科学感谢Baptiste Couvy-Duchesne, Miguel Renteria和其他匿名审稿人对这项工作的同行评审所做的贡献。

额外的信息

出版商的注意施普林格自然对出版的地图和机构附属的管辖权要求保持中立。

补充信息

补充信息

补充图1-4和GWAS数据集的注释。

报告总结

补充表

补充说明表1-15。

权利与权限

Nature或其许可方根据与作者或其他权利所有人签订的出版协议,对本文拥有专有权;作者对本文已接受的手稿版本的自我存档完全受此类出版协议条款和适用法律的约束。

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引用本文

郭建军,于凯,董士生,董建军。et al。孟德尔随机化分析支持脑成像衍生表型和精神障碍风险之间的因果关系。Nat >25, 1519-1527(2022)。https://doi.org/10.1038/s41593-022-01174-7

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