基因电路工程

提高工程功能的进化稳定性对生物生产和合成生物学具有重要意义。在这里，作者开发了一个基于整合酶重组的末端分化基因回路大肠杆菌从总体上提高工程功能的进化稳定性。

外部控制基因表达的能力对生物学研究的各个领域都很重要，尤其是对合成生物学。在这里，作者提出质粒TULIP，它通过化学诱导提供DNA拷贝数控制，以加速在不同背景下基因电路的设计，原型和重用。

位点特异性重组(Site-specific recombination, SSR)是合成生物学中的重要工具，但其应用受到无法预测SSR反应速率的限制。在这里，利用定量高通量实验和机器学习，作者实现了对DNA附着位点序列的合理控制，以可预测地调节体外和细胞中位点特异性重组率。

生物网络的优化常常受到湿实验室劳动力和成本以及缺乏方便的计算工具的限制。在这里，为了民主化和标准化，作者描述了METIS，这是一个模块化和通用的主动机器学习工作流，具有简单的在线界面，用于用最少的实验数据集优化生物目标函数。

支原体是最小的细胞模式生物，但缺乏遗传工具。在这里，作者提供了一个强大的遗传工具包支原体演示基因电路工程应用。