分子模拟

寡核苷酸d(TC₅)在溶液中形成特征良好的四聚体i基序;然而，二聚体和三聚体中间体的分离仍然具有挑战性。在这里，作者报告了2 ' -脱氧-2 ' -氟阿拉伯胞苷取代可以促使TC₅通过氟氧氢键形成二聚i基序折叠中间体。

作者开发了一种计算方法来探测淀粉样原纤维的稳定性，并发现热点相互作用网络。了解淀粉样蛋白折叠的机制将有助于确定治疗蛋白质(错误)折叠疾病的新方法。

在这里，作者展示了H2A。Z组蛋白变体的掺入降低了转录的核小体屏障。此外，他们的模拟揭示了H2A。Z促进DNA自发从组蛋白八聚体展开，并增强核小体缺口。

研究蛋白质结构动力学的计算方法是生命科学中一个强大的工具，但计算成本很高。在这里，作者表明机器学习可以用于有效地生成蛋白质构象集成，并在本质无序的多肽上测试他们的方法。

对不同膜成分的多药耐药蛋白1 (MRP1)的分子动力学模拟表明，膜成分对其结构的影响有限，但会影响其构象转变和底物转运动力学。