研究2022年11月12日|开放获取 焦耳加热和热辐射复合纳米流体二维耗散流输运特性 Aisha M. Alqahtani ,Maawiya Ould Sidi &艾哈迈德·m·加拉尔 科学报告 12, 19374年
研究2022年11月11日|开放获取 一个灵活的跨平台单单元数据处理管道 随着单细胞RNA-seq研究的吞吐量的增加,需要能够使数据分析步骤更加精简和方便的工具。在这里,作者开发了UniverSC,这是一个统一了单细胞RNA-seq分析工作流程的工具,也方便了非专家的使用。 凯巴腾堡蛋糕 ,托马斯·凯利 &阿基Minoda 自然通讯 13, 6847年
研究2022年11月11日|开放获取 dcHiC检测跨多个Hi-C数据集的差异室 哺乳动物基因组的组织在许多生物过程中起着重要作用。在这里,作者报告了dcHiC,这是一种使用多元距离测量来识别多个全基因组染色质接触图之间分隔化变化的工具,并将其应用于不同的人类和小鼠数据集。 Abhijit Chakraborty ,Jeffrey G. Wang &法啊 自然通讯 13, 6827年
研究2022年11月10日|开放获取 使用多实例学习框架从直接RNA测序中检测m6A 这项工作提出了m6Anet,它实现了一个基于神经网络的多实例学习模型,从直接的RNA测序数据中检测m6A修饰。 克里斯托弗·亨德拉 ,策略N.普拉坦瓦尼奇 &乔纳森Goke 自然方法, 1 - 9
编辑|2022年11月11日 听即信 对于盲人和视力受损的天文学家来说,数据的超声波化为研究和推广创造了机会。但对于每个人来说,Focus的这一期展示了用数据超声来补充基于视觉的数据分析工具的好处。 自然天文学, 1
新闻|2022年11月10日 我应该加入乳齿象吗?一份关于Twitter竞争对手的科学家指南 这个开源平台在一周多一点的时间里就增加了近50万用户——但科学家们是否应该迈出这一步呢?我们考察了利弊。 克里斯Stokel-Walker 自然
新闻和观点|2022年11月7日 一种快速定制的元胞分割算法 基于机器学习的普通元胞分割模型在测试图像与训练图像差异很大的情况下表现欠佳。Cellpose 2.0允许生物学家根据自己的成像数据快速训练最先进的分割模型。这在以前只能使用大型的、带注释的数据集,并且需要专业的机器学习知识。 自然方法, 1 - 2
新闻和观点|2022年10月31日 STAARpipeline:一种用于生物银行规模全基因组测序数据的一体化稀有变异工具 在非编码基因组中检测罕见变异关联具有挑战性。我们为生物库规模的全基因组测序数据提出了一个可扩展、灵活和精简的罕见变异关联分析框架,包括基因中心和非基因中心分析,通过使用各种编码和非编码单元、条件分析、结果总结和可视化结合多种变体功能注释。 自然方法, 1 - 2
评论与意见|2022年10月27日 简而言之,为什么在高风险决策中应该避免黑箱机器学习 黑箱机器学习模型对于高风险决策来说可能是危险的。它们依赖于不可靠的数据库,而且它们的预测很难进行故障排除、解释和实时预测的错误检查。它们的使用会导致严重的道德和责任问题。 辛西娅·鲁丁 Nature Reviews Methods引物 2, 81年